位于日喀則西南130公里處的薩迦縣城里，是薩迦派第一座寺院，由薩迦的創始人昆•貢卻杰布于公元1073年創建。薩迦寺是全國重點文物保護單位之一。寺中藝術珍品浩瀚，文物價值又極高，因此被人們稱為“第二個敦煌”。薩，藏語意為土；迦，藏語意為灰色，相傳該地苯波山上的巖石風化后成為灰色的土，這就是薩迦地名的來歷。

十三世紀中葉，西藏地區成為元朝的一個行政區域，并在元朝扶持下，建立了薩迦地方政權。元世祖忽必烈封薩迦第五代法王八思巴為國師，令其統管全國佛教事務并主持西藏地區的政務。北寺就是當時行政事務機關的所在地。

薩迦寺分南北兩寺，以仲曲河為界，北寺修在北岸苯波山前，始建于宋神宗元豐二年（1079年），北寺規模宏大，為一片重疊逶迤的建筑群，在“文化大革命”中遭到毀滅性破壞。現在只有薩迦南寺尚存。星羅棋布的村舍沿山腳向平原展開，直至與縣城連接起來。那些別致的房屋有秩序地排列著，古樸的街巷也很有規矩，這種形制獨特的村舍在西藏可并不多見。